处方药奥美拉唑钠有注射剂、胶囊等不同制剂。其主要成分为奥美拉唑钠。其中，处方药奥美拉唑钠静脉注射时，一次40mg，每日1～2次。临用前将10ml专用溶剂注入冻干粉小瓶内，禁止用其它溶剂溶解。处方药奥美拉唑钠溶解后必须在2小时内使用，推注时间不少于20分钟。
处方药奥美拉唑钠对胃蛋白酶分泌也有抑制作用，对胃黏膜血流量改变不明显，也不影响体温、胃腔温度、动脉血压、静脉血红蛋白、动脉氧分压、二氧化碳分压及动脉血pH。偶可见有一过性的轻度恶心、腹泻、腹痛、感觉异常、头晕或头痛等，但不影响治疗。
由于处方药奥美拉唑钠在肝脏中通过细胞色素F4502C19（CYP2C19）代谢，会延长其它酶解物如地西泮、华法林（R—华法林）和苯妥英的清除。处方药奥美拉唑钠与华法林和苯妥英治疗时应给予监测，必要时应予减低华法林或苯妥英之剂量。持续使用苯妥英治疗的患者同时每天一次给予本品20mg，苯妥英的血药浓度并不受影响。