应用
食品
磷酸三钙是一种安全的营养强化剂，主要添加在食品中强化钙的摄入，也可用于预防或治疗钙缺乏的症状。同时磷酸三钙还可作为食品中的抗结剂、 PH 值调节剂，缓冲剂等。如作面粉抗结剂（分散剂），奶粉、糖果，布丁、调味品、肉类的添加剂，动物油精炼助剂，酵母食料等。
微囊包埋磷酸三钙，人体最佳钙源之一
由西班牙Lipofoods公司生产的微囊包埋钙（LIPOCAL），是一种以磷酸三钙为原料，经过超细粉碎后，再用卵磷脂包裹成直径为3－5微米的微胶囊的一种钙制品。
LIPOCAL的高吸收性，归功于其使用了卵磷脂进行包埋。由于卵磷脂的分子结构与肠上皮细胞的细胞膜中磷脂分子结构相似，当卵磷脂与细胞膜交换或者直接嵌入时，可以增加肠上皮细胞膜的流动性，因此可以增强营养物质的吸收性。当钙从微胶囊中释放出来，便能够很容易地穿透肠粘膜或细胞间隙进入血液循环。西班牙巴塞罗那大学一项实验显示：磷酸三钙经过微囊化包埋后，生物利用度可提高41%。
此外，磷酸三钙作为日常钙源之一，相比其它补钙产品，其优势在于可同时提供钙和磷。身体内的钙和磷保持平衡非常重要，因为这两种矿物质都是骨骼形成的必需物质，所以如果不能达到两种物质的均衡，而只是单纯补钙则通常难以达到理想的补钙效果。
医学
磷酸三钙具有良好的生物相容性、生物活性以及生物降解性,是理想的人体硬组织修复和替代材料,在生物医学工程学领域一直受到人们的密切关注。医学上通常使用的是磷酸三钙的一种特殊形态—β-磷酸三钙。
β-磷酸三钙主要是由钙、磷组成，其成分与骨基质的无机成分相似，与骨结合好。动物或人体细胞可以在β-磷酸三钙材料上正常生长，分化和繁殖。通过大量实验研究证明：β-磷酸三钙对骨髓造血机能无不良反应，无排异反应，无急性毒性反应，不致癌变，无过敏现象。因此β-磷酸三钙可广泛应用于关节与脊柱融合、四肢创伤、口腔颌面的外科、心血管外科，以及填补牙周的空洞等方面。随着人们对β-磷酸三钙研究的不断深入，其应用形式也出现了多样化，并在临床医学中体现了较好的性能。
梁戈等通过实验发现其溶血程度<5%，当β-磷酸三钙被植入人体内后，其在体液中能发生降解和吸收，钙、磷被体液吸收后进入人体循环系统，一定时间后植入人体的β-磷酸三钙逐渐溶解消失，形成新骨。
Arai等利用β-磷酸三钙多孔陶瓷填充8～15cm 的腓骨节段缺损，获得了腓骨再生。平均术后2个月即可达到重建。不会发生踝关节及胫骨的移位。
郑承泽等将β-磷酸三钙与自体骨髓复合应用于临床，修复包括肿瘤性骨缺损和陈旧性骨折骨缺损,经术后调查，结果显示植入材料的成骨作用明显，说明β-磷酸三钙与自体骨髓复合是一种治疗骨缺损理想的方法。
张汉东等将磷酸三钙陶瓷用于修复兔下颌骨缺损,研究表明，植入后局部组织无明显炎症等反应。
张建设等将两种不同组成的β-磷酸三钙陶瓷植入免颌骨人工缺损区，掺杂的磷酸三钙陶瓷降解速度较慢，但具有较好的生物相容性。
张亮等利用β-磷酸三钙/DL—PLA 作为一种新型治疗骨缺损的材料，研究表明其降解特点有利于骨组织细胞长入。
