巴马亭红碱(16176-68-4)

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16176-68-4
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基本信息

  • 巴马亭红碱
  • 16176-68-4
  • 巴马亭红碱
  • C20H20NO4
  • 338.37700
  • Dibenzo[a,g]quinolizinium,5,6-dihydro-9-hydroxy-2,3,10-trimethoxy-
  • Berbinium,7,8,13,13a-tetradehydro-9-hydroxy-2,3,10-trimethoxy- (8CI); Palmatrubin;Palmatrubine; Palmaturbine

详细信息

棕榈红碱的化学性质

化学文摘号 16176-68-4    
PubChem 编号 10547386 外貌 粉末
分子式 C20H20NO4 分子量 338.38
化合物类型 生物碱 贮存 在 -20°C 下干燥
溶解度 可溶于氯仿、二氯甲烷、乙酸乙酯、DMSO、丙酮等。
化学名称 2,3,10-三甲氧基-5,6-二氢异喹啉[2,1-b]异喹啉-7-鎓-9-醇
SMILES COC1=C(C2=C[N+]3=C(C=C2C=C1)C4=CC(=C(C=C4CC3)OC)OC)O
标准InChIKey QBUIDYLGKMWNEA-UHFFFAOYSA-O
标准InChI InChI=1S/C20H19NO4/c1-23-17-5-4-12-8-16-14-10-19(25-3)18(24-2)9-13(14)6-7-21( 16)11-15(12)20(17)22/h4-5,8-11H,6-7H2,1-3H3/p+1
一般提示 为了获得更高的溶解度,请将管加热至 37 ℃ 并在超声波槽中摇晃片刻。原液可在 -20℃ 以下保存数月。
我们建议您当天配制和使用该溶液。但是,如果测试计划需要,可以提前配制原液,并且原液必须密封并保存在 -20℃ 以下。一般情况下,原液可以保存数月。
使用前,我们建议您将小瓶在室温下放置至少一个小时后再打开。
关于包装 1. 产品包装在运输过程中可能会被颠倒,导致高纯度化合物粘附在瓶颈或瓶盖上。将瓶从包装中取出,轻轻摇晃,直到化合物沉到瓶底。
2. 对于液体产品,请以 500xg 的速度离心,使液体聚集到瓶底。
3. 尽量避免实验过程中的丢失或污染。
运输条件 根据客户要求包装(5mg、10mg、20mg 及以上)。

棕榈红碱的来源

箭叶青牛胆草

棕榈红碱的生物活性

描述 棕榈红碱很可能通过插入模式与双链 DNA 结合。

帕玛红碱的实验方案

结构鉴定

Chem Biodivers. 2007 年 2 月;4(2):145-53。

原小檗碱及其去甲基化衍生物的 DNA 结合亲和力和序列特异性:一项比较研究。[Pubmed:17311227 ]


方法与结果:
通过对小檗碱(1)、药根碱(2)和巴马汀(3)进行部分去甲基化,分别化学制备小檗红碱(1a)、药根红碱(2a)和巴马汀红碱(3a)。通过竞争性溴化乙锭(EB)置换实验研究了它们与小牛胸腺(CT)DNA、聚(dA-dT)聚(dA-dT)、聚(dG-dC)聚(dG-dC)和八种富含AT的12聚体双链DNA的相互作用。结果表明,部分去甲基化显著提高了这些原小檗碱生物碱与DNA的结合亲和力,并且所有这些生物碱与富含AT的DNA均具有较好的结合亲和力。尤其是去甲基化衍生物1a、2a和Palmatrubine与母体生物碱1、2、3的DNA结合序列特异性发生了一定程度的改变,并通过紫外光谱滴定实验进一步证实了这些生物碱的结合方式。
结论:
所有化合物均以插入方式与双链DNA结合。

制备 Palmatrubine 储备溶液

  1毫克 5毫克 10毫克 20毫克 25 毫克
1 毫米 2.9553 毫升 14.7763 毫升 29.5526 毫升 59.1051 毫升 73.8814 毫升
5 毫米 0.5911 毫升 2.9553 毫升 5.9105 毫升 11.821 毫升 14.7763 毫升
10 毫米 0.2955 毫升 1.4776 毫升 2.9553 毫升 5.9105 毫升 7.3881 毫升
50 毫米 0.0591 毫升 0.2955 毫升 0.5911 毫升 1.1821 毫升 1.4776 毫升
100 毫米 0.0296 毫升 0.1478 毫升 0.2955 毫升 0.5911 毫升 0.7388 毫升
*注:如果您在实验过程中,需要对样品进行稀释,以上稀释数据仅供参考,一般在较低的浓度下即可获得较好的溶解性

Palmatrubine 的参考文献

原小檗碱及其去甲基化衍生物的 DNA 结合亲和力和序列特异性:一项比较研究。[Pubmed:17311227 ]

Chem Biodivers. 2007 年 2 月;4(2):145-53。

通过对小檗碱 (1)、药根碱 (2) 和巴马汀 (3) 进行部分去甲基化,分别化学制备了小檗红碱 (1a) 药根红碱 (2a) 和巴马汀 (3a)。通过竞争性溴化乙锭 (EB) 置换实验研究了它们与小牛胸腺 (CT) DNA、聚 (dA-dT) 聚 (dA-dT)、聚 (dG-dC) 聚 (dG-dC) 和 8 种富含 AT 的 12 聚体双链 DNA 的相互作用。结果表明,部分去甲基化显著提高了这些原小檗碱生物碱与 DNA 的结合亲和力,并且所有这些生物碱与富含 AT 的 DNA 均具有较好的结合亲和力。尤其是去甲基化衍生物1a、2a、3a与母体生物碱1、2、3相比,其与DNA结合的序列特异性发生了一定程度的改变,并通过紫外光谱滴定实验进一步证实了这些生物碱的结合方式,所有化合物均很可能以插入方式与双链DNA结合。

描述

棕榈碱是从 T. sinensis 中分离出来的。

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湖北萃园生物科技有限公司

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